Les teneurs en fluorure des plantes influencent-elles leur qualité fourragère pour ruminant ?

Fluoride poisoning is a major health problem that handicaps the ruminant production. The hypothesis put forward by the present study is that the fluoride content of different plant species (cultivated or spontaneous) collected in three south communes of Khouribga known by hydrotelluric fluorosis and in one unscathed commune (Ouled Saaid) affects their forage quality. To verify this hypothesis, samples of aerial plants parts were collected, dried, crushed and sieved. Then the average fluoride contents were determined using a specific electrode. The contents of protein (MAT), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF) and acid detergent lignin (ADL) were also determined. The results showed that the highest fluoride content was recorded in El Fokra (4.96±1.72 ppm) followed by M'fassis (3.79±1.04 ppm), while the lowest levels were found in Ouled Azzouz (2.24±1.77 ppm) and Ouled Saaid (1.92±0.89 ppm). In addition, Fumaria parviflora, Chrysanthemum coronarium, and Hordeum vulgare accumulated the highest levels of fluoride compared to other species. No significant difference between the plants for MAT of the four communes studied was observed. In addition, the species with high fluoride levels showed low levels of NDF (24.25±5.87 %DM), ADF (10.17±6.4 %DM) and ADL (2.32±0.79 %DM). In conclusion, in the non-free areas, fluoride levels at the plant varied by species and by region. In addition, the plants of the communes Ouled Azzouz and Ouled Saaid which have a low level of fluoride present high levels of fibres.L’intoxication par le fluorure est un problème majeur de santé qui handicape la production des ruminants. L’hypothèse avancée par la présente étude est que la teneur en fluorure affecte la qualité fourragère de différentes espèces de plantes (cultivées ou spontanées) consommées par les ruminants et collectées dans trois communes (El Fokra, Ouled Azzouz et M’fassis) connues par la fluorose hydrotellurique au sud de Khouribga et dans une commune indemne (Ouled Saaid au nord de Settat). Pour vérifier cette hypothèse, des échantillons des parties aériennes des plantes ont été collectés, séchés, broyés et tamisés. Ensuite, les teneurs en fluorure ont été déterminées à l’aide d'une électrode spécifique. Les teneurs en matières azotées totales (MAT), en fibre au détergent neutre (NDF), en fibre au détergent acide (ADF) et en lignine sulfurique (ADL) ont été également déterminées. Les résultats montrent que la teneur la plus élevée en fluorure a été enregistré dans la commune El Fokra (4,96±1,72 ppm) suivi par la commune M'fassis (3,79±1,04 ppm), alors que les teneurs les plus faibles ont été observées à Ouled Azzouz (2,24±1,77 ppm) et Ouled Saaid (1,92±0,89 ppm). De plus, Fumaria parviflora, Chrysanthemum coronarium et Hordeum vulgare ont accumulé les taux les plus élevés en fluorure par rapport aux autres espèces. Aucune différence significative n’a été observée au niveau de la teneur en fluorure pour les plantes des communes Ouled Azzouz et Ouled Saaid. Aucune différence significative entre les plantes pour les MAT des quatre communes étudiées n’a été observée. De plus, les espèces qui présentent un taux élevé en fluorure ont montré de faibles teneurs en NDF (24,25 ± 5,87 %MS), ADF (10,17±6,4 %MS) et ADL (2,32±0,79 %MS). En conclusion, dans les régions à fluorose, le taux de fluorure au niveau des plantes varie selon l’espèce et selon le degré de contamination de la région. En outre, les plantes des communes Ouled Azzouz et Ouled Saaid qui ont un faible taux de fluorure présentent des niveaux élevés de fibres

First draft genome assembly of the Argane tree (Argania spinosa)

Background: The Argane tree (Argania spinosa L. Skeels) is an endemic tree of southwestern Morocco that plays an important socioeconomic and ecologic role for a dense human population in an arid zone. Several studies confirmed the importance of this species as a food and feed source and as a resource for both pharmaceutical and cosmetic compounds. Unfortunately, the argane tree ecosystem is facing significant threats from environmental changes (global warming, over-population) and over-exploitation. Limited research has been conducted, however, on argane tree genetics and genomics, which hinders its conservation and genetic improvement. Methods: Here, we present a draft genome assembly of A. spinosa. A reliable reference genome of A. spinosa was created using a hybrid de novo assembly approach combining short and long sequencing reads. Results: In total, 144 Gb Illumina HiSeq reads and 7.2 Gb PacBio reads were produced and assembled. The final draft genome comprises 75 327 scaffolds totaling 671 Mb with an N50 of 49 916 kb. The draft assembly is close to the genome size estimated by k-mers distribution and covers 89% of complete and 4.3 % of partial Arabidopsis orthologous groups in BUSCO. Conclusion: The A. spinosa genome will be useful for assessing biodiversity leading to efficient conservation of this endangered endemic tree. Furthermore, the genome may enable genome-assisted cultivar breeding, and provide a better understanding of important metabolic pathways and their underlying genes for both cosmetic and pharmacological purposes

First draft genome assembly of the Argane tree (Argania spinosa) [version 2; peer review: 2 approved]

BACKGROUND : The Argane tree (Argania spinosa L. Skeels) is an endemic tree of mid-western Morocco that plays an important socioeconomic and ecologic role for a dense human population in an arid zone. Several studies confirmed the importance of this species as a food and feed source and as a resource for both pharmaceutical and cosmetic compounds. Unfortunately, the argane tree ecosystem is facing significant threats from environmental changes (global warming, over-population) and over-exploitation. Limited research has been conducted, however, on argane tree genetics and genomics, which hinders its conservation and genetic improvement. METHODS : Here, we present a draft genome assembly of A. spinosa. A reliable reference genome of A. spinosa was created using a hybrid de novo assembly approach combining short and long sequencing reads. RESULTS : In total, 144 Gb Illumina HiSeq reads and 7.6 Gb PacBio reads were produced and assembled. The final draft genome comprises 75 327 scaffolds totaling 671 Mb with an N50 of 49 916 kb. The draft assembly is close to the genome size estimated by k-mers distribution and covers 89% of complete and 4.3 % of partial Arabidopsis orthologous groups in BUSCO. CONCLUSION : The A. spinosa genome will be useful for assessing biodiversity leading to efficient conservation of this endangered endemic tree. Furthermore, the genome may enable genome-assisted cultivar breeding, and provide a better understanding of important metabolic pathways and their underlying genes for both cosmetic and pharmacological.DATA AVAILABILITY: All of the A. spinosa datasets can be retrieved under BioProject accession number PRJNA294096: http://identifiers.org/ bioproject:PRJNA294096. The raw reads are available at NCBI Sequence Reads Archive under accession number SRP077839: http://identifiers.org/insdc.sra:SRP077839. The complete genome sequence assembly project has been deposited at GenBank under accession number QLOD00000000: http://identifiers. org/ncbigi/GI:1408199612. Data can also be retrieved via the International Argane Genome Consortium (IAGC) website: http://www.arganome.org.https://f1000research.compm2021BiochemistryGeneticsMicrobiology and Plant Patholog

La fluorose endémique chez les ruminants et son impact socio-économique au Maroc

Au Maroc, l'élevage des ruminants est un secteur à une grande valeur socio-économique. Il contribue à la production nationale de viande rouge, fournit également des emplois à une importante population rurale et constitue la principale source de revenus pour la plupart des éleveurs. Pourtant, dans les zones phosphatées, cette filière est confrontée un défi environnemental due à un excès de fluor. L'ingestion et/ou l'inhalation chronique de cet élément par les ruminants exerce divers effets toxiques influençant les performances de l'animal et entraînant ainsi des conséquences socio-économiques importantes. Les données des études précédentes concernant la répartition géographique de la fluorose au Maroc, le métabolisme du fluor chez les ruminants ainsi que ses effets nocifs à savoir la fluorose dentaire, squelettique et non squelettique chez les ruminants (ovins, caprins, bovins) ont été clairement résumées dans cette revue. De plus, l'impact socio-économique, et les progrès actualisés en termes de prévention ou de réduction de la fluorose sont passés en revue. Cette revue mit également en évidence la nécessité de réaliser des investigations complémentaires sur la fluorose endémique chez les ruminants

Les teneurs en fluorure des plantes influencent-elles leur qualité fourragère pour ruminant ?

Fluoride poisoning is a major health problem that handicaps the ruminant production. The hypothesis put forward by the present study is that the fluoride content of different plant species (cultivated or spontaneous) collected in three south communes of Khouribga known by hydrotelluric fluorosis and in one unscathed commune (Ouled Saaid) affects their forage quality. To verify this hypothesis, samples of aerial plants parts were collected, dried, crushed and sieved. Then the average fluoride contents were determined using a specific electrode. The contents of protein (MAT), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF) and acid detergent lignin (ADL) were also determined. The results showed that the highest fluoride content was recorded in El Fokra (4.96±1.72 ppm) followed by M'fassis (3.79±1.04 ppm), while the lowest levels were found in Ouled Azzouz (2.24±1.77 ppm) and Ouled Saaid (1.92±0.89 ppm). In addition, Fumaria parviflora, Chrysanthemum coronarium, and Hordeum vulgare accumulated the highest levels of fluoride compared to other species. No significant difference between the plants for MAT of the four communes studied was observed. In addition, the species with high fluoride levels showed low levels of NDF (24.25±5.87 %DM), ADF (10.17±6.4 %DM) and ADL (2.32±0.79 %DM). In conclusion, in the non-free areas, fluoride levels at the plant varied by species and by region. In addition, the plants of the communes Ouled Azzouz and Ouled Saaid which have a low level of fluoride present high levels of fibres.L’intoxication par le fluorure est un problème majeur de santé qui handicape la production des ruminants. L’hypothèse avancée par la présente étude est que la teneur en fluorure affecte la qualité fourragère de différentes espèces de plantes (cultivées ou spontanées) consommées par les ruminants et collectées dans trois communes (El Fokra, Ouled Azzouz et M’fassis) connues par la fluorose hydrotellurique au sud de Khouribga et dans une commune indemne (Ouled Saaid au nord de Settat). Pour vérifier cette hypothèse, des échantillons des parties aériennes des plantes ont été collectés, séchés, broyés et tamisés. Ensuite, les teneurs en fluorure ont été déterminées à l’aide d'une électrode spécifique. Les teneurs en matières azotées totales (MAT), en fibre au détergent neutre (NDF), en fibre au détergent acide (ADF) et en lignine sulfurique (ADL) ont été également déterminées. Les résultats montrent que la teneur la plus élevée en fluorure a été enregistré dans la commune El Fokra (4,96±1,72 ppm) suivi par la commune M'fassis (3,79±1,04 ppm), alors que les teneurs les plus faibles ont été observées à Ouled Azzouz (2,24±1,77 ppm) et Ouled Saaid (1,92±0,89 ppm). De plus, Fumaria parviflora, Chrysanthemum coronarium et Hordeum vulgare ont accumulé les taux les plus élevés en fluorure par rapport aux autres espèces. Aucune différence significative n’a été observée au niveau de la teneur en fluorure pour les plantes des communes Ouled Azzouz et Ouled Saaid. Aucune différence significative entre les plantes pour les MAT des quatre communes étudiées n’a été observée. De plus, les espèces qui présentent un taux élevé en fluorure ont montré de faibles teneurs en NDF (24,25 ± 5,87 %MS), ADF (10,17±6,4 %MS) et ADL (2,32±0,79 %MS). En conclusion, dans les régions à fluorose, le taux de fluorure au niveau des plantes varie selon l’espèce et selon le degré de contamination de la région. En outre, les plantes des communes Ouled Azzouz et Ouled Saaid qui ont un faible taux de fluorure présentent des niveaux élevés de fibres

Les effets amélioratifs des extraits de plantes sur la préservation du sperme de béliers et sa capacité de fertilisation

La conservation à l’état liquide ainsi que la cryoconservation de la semence de bélier sont des étapes clés dans la réussite de l'insémination artificielle. Cependant, la manipulation de la semence entraîne généralement une diminution progressive de sa qualité et de sa capacité de fécondation. Dans les deux méthodes de conservation, les chocs thermique et osmotique ainsi que le choix inapproprié du dilueur pourraient conduire aux dommages oxydatifs induits par les espèces réactives de l'oxygène sur les spermatozoïdes. Par conséquent, des études antérieures se sont concentrées sur la supplémentation de dilueurs par des antioxydants exogènes afin de réduire le stress oxydatif produit lors de la conservation du sperme de bélier. Récemment, des biomolécules provenant de produits naturels ont été additionnés au dilueurs. Cet article vise à présenter en détail les facteurs influençant la qualité de la semence de bélier lors de la conservation en sperme frais ou congelé. En outre, les résultats des études portant sur l'utilisation des extraits ou des biomolécules naturelles à différentes doses sont discutés. Précisément, une mise à jour concernant leurs effets sur la qualité du sperme et sa capacité de fécondation in vivo ou in vitro est fournie dans cette revue

Assessment of physicochemical parameters, bioactive compounds, biological activities, and nutritional value of the most two commercialized pollen types of date palm (Phoenix dactylifera L.) in Morocco.

peer reviewedThe pollen of date palm (Phoenix dactylifera L.) is known for its nutritional value and implications as a health-promoting component. Due to its low cost, date palm pollen crushed with its spadix is more widely commercialized and used in Morocco than pure date palm pollen free of spadix. Thus, this study aimed to assess the physicochemical and phytochemical parameters, biological activities, and nutritional value of the two pollen types: Pure date palm pollen and date palm pollen crushed with its spadix. Various physicochemical parameters were determined, including humidity, water activity (aw), total soluble solids, ash content, and color parameters (L*, a*, b*, C*ab, and hab). Additionally, the phenolic compound profiles were analyzed, and the in vitro antioxidant, enzyme inhibitory, and antidiabetic activities were assessed for both pure date palm pollen and date palm pollen crushed with its spadix. Furthermore, the nutritional value was evaluated by determining protein and carbohydrate contents, and mineral and fatty acid profiles. The results have revealed that pure date palm pollen had higher humidity, aw, L*, and hab color parameters than date palm pollen crushed with its spadix, but lower total soluble solid and ash contents. The main phenolic compounds in pure date palm pollen were ellagic acid, rutin, fisetin, and quercetin, whereas date palm pollen crushed with its spadix contained mainly catechin, chlorogenic acid, p-coumaric acid, ferulic acid, and rutin. Moreover, pure date palm pollen showed greater in vitro antioxidant activity, while date palm pollen crushed with its spadix had higher enzyme inhibitory and antidiabetic activities. PDPS was the richest source of proteins, carbohydrates, minerals, and saturated fatty acids, while date palm pollen crushed with its spadix was a better source of unsaturated fatty acids, which are mainly represented by linoleic acid. In conclusion, although date palm pollen crushed with its spadix is the most widely consumed type, its nutritional value is lower than that of pure date palm pollen. Thus, pure date palm pollen could potentially serve as a better source of many bioactive compounds, making it a viable supplement for various health applications

First draft genome assembly of the Argane tree (Argania spinosa)

BACKGROUND : The Argane tree (Argania spinosa L. Skeels) is an endemic tree of southwestern Morocco that plays an important socioeconomic and ecologic role for a dense human population in an arid zone. Several studies confirmed the importance of this species as a food and feed source and as a resource for both pharmaceutical and cosmetic compounds. Unfortunately, the argane tree ecosystem is facing significant threats from environmental changes (global warming, over-population) and over-exploitation. Limited research has been conducted, however, on argane tree genetics and genomics, which hinders its conservation and genetic improvement. METHODS : Here, we present a draft genome assembly of A. spinosa. A reliable reference genome of A. spinosa was created using a hybrid de novo assembly approach combining short and long sequencing reads. RESULTS : In total, 144 Gb Illumina HiSeq reads and 7.2 Gb PacBio reads were produced and assembled. The final draft genome comprises 75 327 scaffolds totaling 671 Mb with an N50 of 49 916 kb. The draft assembly is close to the genome size estimated by k-mers distribution and covers 89% of complete and 4.3 % of partial Arabidopsis orthologous groups in BUSCO. CONCLUSION : The A. spinosa genome will be useful for assessing biodiversity leading to efficient conservation of this endangered endemic tree. Furthermore, the genome may enable genome-assisted cultivar breeding, and provide a better understanding of important metabolic pathways and their underlying genes for both cosmetic and pharmacological purposes.This work was supported by the Iridian Genome Foundation (MD, USA). H.G. is supported by a Grant from the NIH (MD, USA) for H3ABioNet/H3Africa (grant numbers U41HG006941 and U24 HG006941). O.B. and B.C. are Fulbright JSD (USA) grant recipients. This work also benefited from support of Midterm Research Program of INRA-Morocco through the use of its bioinformatics platform.https://f1000research.comam2019Genetic